先通過IP得到目的蛋白,再通過SDS-PAGE對目的蛋白進(jìn)行分離純化,將膠條上目的蛋白對應(yīng)的條帶切下進(jìn)行膠內(nèi)酶解和高靈敏度的液質(zhì)聯(lián)用分析(LC-MS/MS),通過數(shù)據(jù)庫檢索得到蛋白上的修飾位點(diǎn)。
蛋白分析的應(yīng)用
1. 磷酸化:信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞周期、生長發(fā)育及癌癥機(jī)理等;
2.糖基化:蛋白質(zhì)折疊、更新以及免疫應(yīng)答等;
3.乙?;夯虮磉_(dá)調(diào)控、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞代謝、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性以及神經(jīng)退行性病變等;
4.泛素化:細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA修復(fù)以及信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等;
5.甲基化:染色質(zhì)結(jié)構(gòu)及轉(zhuǎn)錄調(diào)控等;
6.丙?;?/ 丙二?;?/ 戊二酰化 / 琥珀?;褐饕嬖谟诰€粒體和細(xì)菌中,與代謝過程密切相關(guān)。
實(shí)驗(yàn)流程
1.IP溶液/膠條;
2.蛋白酶消化;
3.LC-MS/MS分析;
4.搜庫后分析,蛋白鑒定、翻譯后修飾分析。
實(shí)驗(yàn)完成周期及交付標(biāo)準(zhǔn)
1. 周期:6周左右
2. 交付標(biāo)準(zhǔn):質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)、白鑒定列表、肽段信息表、實(shí)驗(yàn)報(bào)告(主要儀器、試劑和實(shí)驗(yàn)方法)
需確認(rèn)的信息
1. 樣品:如果樣品為蛋白質(zhì)溶液,蛋白質(zhì)總量≥300mg; 如果是組織樣品,樣品總量≥0.1g; 如果是細(xì)胞樣品,細(xì)胞數(shù)量≥107個;如果是體液樣品,血清≥200ml,腦脊液≥200ml,尿液≥1ml,淚液≥1ml;
2. 樣品采集過程中使用到塑料制品時,盡量使用無色進(jìn)口產(chǎn)品,以減少塑料制品中雜質(zhì)對質(zhì)譜檢測的影響;
3. 確認(rèn)樣品所屬種屬、分析需求。